納戸町はそもそも天龍寺の門前町（下図の青色）でした。下図で江戸時代の延宝年間（1673－1681年）です。この時代、将来の納戸町になる青色の町が三つありました。なお、納戸とは物置部屋で、服や調度類、器財など物品を収納します。また、天龍寺は天和３年（1683年）に火事で類焼し、新宿四丁目に引っ越しします。
地図で見る新宿区の移り変わり。昭和57年。新宿区教育委員会。延宝年間（1673年から1681年まで）
町方書上（文政８年、1825。再版は新宿近世文書研究会、平成８年）では
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町内里俗之唱
一 町内東之方北側片側町之所、里俗木津屋町与唱申候、年代不知、先年木津屋与申、太物、醤油類渡世仕候者罷在候ニ付、里俗右之如く唱候由
一 同中御徒町通南側、里俗竹町与唱申候、寛永十二亥年 天龍寺御用ニ付、被召上候跡竹薮ニ有之候場所故、竹町与唱候由
一 同所飛地、弐拾騎町続之所、里俗墓町与唱申候、天龍寺墓所ニ有之候由
一 同所裏通り、御細工町江隣り候処、表大門与里俗唱申候天龍寺大門有之候由申傅候
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太物 太物は呉服（絹織物）と正反対で、太い糸の織物の総称。綿織物や麻織物など。
つまり、納戸町の東方は木津屋町、中御徒町（現在の中町）と同じ通りを竹町、飛地は墓町、御細工町と隣り合った通りを表大門と呼んでいます。
また、「市ヶ谷牛込絵図」（安政６年、1857年）では…
通りは表大門だけではなく、裏大門も出ています。さらに通りには木ヅヤ丁、タケ丁もでて、合計で３つの通りが出てきました。木ヅヤ丁は、木津屋丁に、タケ丁は竹丁に変えることができます。現在の言葉では木津屋路地、竹路地でしょうか。
新宿歴史博物館『新修新宿区町名誌』（平成22年、新宿歴史博物館）によれば、慶応四年（1868）、牛込御納戸町は「御」の字を削除して牛込納戸町に、明治44年（1911）牛込も省略し、納戸町となったようです。
さらに牛込中央通りの一部を通り、銀杏坂通り、中根坂、鼠坂は納戸町から出ます。以上をまとめて……。なお、士邸とは武士の邸宅です。
